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EB病毒微RNAs在结肠癌中的差异表达及其靶基因的功能预测

张欢欢;马月;胡毅翔;余陈欢;应华忠

摘要: 目的 筛选结肠癌样本中差异表达的EB病毒微RNAs (microRNAs),并对其靶基因进行功能预测分析.方法 采用Exiqon LNATM microRNA芯片分析结肠癌组织和癌旁组织之间差异表达的内源microRNAs和EB病毒microRNAs.以人类mRNA为靶标,采用3种方法预测EB病毒microRNAs的靶基因,并通过Gene Ontology分析与Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes分析预测靶基因的生物学功能.结果 芯片分析得到3个相对于癌旁组织和结肠癌组织表达显著下调的EB病毒microRNAs,生物信息学分析预测其靶基因有329个,其中48个(14.6%)靶基因参与细胞膜组成,86个(26.1%)靶基因在离子结合方面发挥功能,并影响代谢通路、钙离子信号转导、Wnt信号、T细胞受体等多个信号通路.结论 筛选得到3个结肠癌异常表达的EB病毒microRNAs,其靶基因参与信号传导和物质代谢路径,可能影响结肠癌发生发展.

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