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贵州省2012年度禽流感病毒H5N1亚型HA-1基因分析

庄丽;蒙黎明;赵文荣;宋倩

摘要: 目的 建立并完善贵州省禽流感病毒基因分析检测技术平台,了解贵州省禽流感病毒H5N1亚型HA1片断与WHO公布的流行株比对有否发生变异.方法 收集禽流感H5N1亚型病毒毒株,提取病毒核酸RNA,通过RT-PCR扩增HA1片断,用电泳观察PCR产物目的条带大小,经过纯化、测序,用Biodeit、MEGA4相关软件进行序列比对,进行差异性分析,构建系统发育树.结果 贵州省禽流感病毒H5N1亚型中鸭来源的禽流感病毒组成一个分支,组内差异性在0.00~5.00之间;鸡来源的禽流感病毒组成另外一个分支,组内高度同源,差异性为零.结论 贵州省禽流感病毒在物种之间存在一定的种属特异性.并且与湖南省的禽流感病毒亲缘关系较近,这与两省之间地理交界有关.

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