通过干性指数分析鉴定控制乳腺癌干细胞特征的关键基因。

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摘要:

背景: 随着肿瘤异质性的逐渐显现,肿瘤干细胞 (CSCs) 现在被认为是肿瘤起始的初始成分。然而,乳腺癌 (BRCA) 干细胞的生长和维持的机制仍然是未知的。 方法: 为了探索调控 BRCA 干性特征的关键基因,我们结合癌症基因组图谱 (TCGA) 样本的基因表达值和基于 mRNA 表达的干性指数 (mRNAsi), 并使用肿瘤纯度 (校正的 mRNAsi) 校正 mRNAsi。MRNAsi 和校正的 mRNAsi 分析显示与 BRCA 临床特征密切相关,包括肿瘤深度、病理分期和生存状态。接下来,应用加权基因共表达网络分析 (WGCNA) 区分关键基因模块和关键基因。使用多个数据库进行了一系列功能分析和关键基因的表达验证,包括 Oncomine 、基因表达综合分析 (GEO) 和基因表达谱综合分析 (GEPIA)。 结果: 本研究发现 BRCA 组织中 mRNAsi 和校正 mRNAsi 评分均高于正常组织,且均随肿瘤分期而增加。较高的校正 mRNAsi 评分显示总体生存结局较差。我们筛选了 3 个模块和 32 个关键基因,发现这些关键基因彼此之间有很强的相关性。功能分析发现,关键基因与细胞周期、细胞衰老、染色体分离和有丝分裂核分裂等细胞命运决定事件有关。在 32 个关键基因中,我们确定了 12 个与 BRCA 存活密切相关的基因。 结论: 发现 32 个基因与 BRCA 干细胞特性密切相关; 其中 12 个基因在 BRCA 患者中表现出预后导向效应。BRCA 中与干性相关的最显著的信号通路是细胞周期通路,这可能支持筛选抑制 BRCA 干细胞特性的治疗靶点的新思路。这些发现可能突出了一些抑制 BRCA 干细胞的治疗靶点。

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Journal of Translational Medicine

J TRANSL MED
最新影响因子:

5.531

期刊ISSN:

1479-5876

研究方向:

医学-医学:研究与实验

CiteScore:

4.1

出版年份:

2003

出版地区:

ENGLAND

出版周期:

Bimonthly

是否OA:

YES

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Journal of Translational Medicine 期刊简介

英文简介:

Published by BioMed Central. ISSN: 1479-5876. Journal of Translational Medicine is an open access journal publishing articles focusing on information derived from human experimentation so as to optimise the communication between basic and clinical science. The journal covers all areas of translational medicine but also has several specialized sections: Cancer microenvironment - Edited by Davide Bedognetti Cardiovascular, metabolic and lipoprotein translation- Edited by Nehal N. Mehta Cell, tissue and gene therapy - Edited by David Stroncek Clinical translation - Edited by Lana Kandalaft Combination strategies - Edited by Paolo A. Ascierto Computational modelling and Epidemiology- Edited by Michael Liebman and Sabrina Molinaro Disease biomarkers - Edited by Xiangdong Wang Illnesses of Unknown Etiology - Edited by Monica Panelli Immunobiology and immunotherapy - Edited by Adrian Bot Immunovirology - Edited by Luigi Buonaguro Medical bioinformatics - Edited by Samir K. Brahmachari Neuroscience - Edited by Luis F. Alguacil Nutrition & metabolism - Edited by Laura Soldati Pain, critical care and anesthesia - Edited by Yasin S. Al Makadma Patient-targeted molecular therapies - Edited by Francesco Chiappelli Personalised medicine - Edited by Lotfi Chouchane Translational imaging - Edited by Ravinder Reddy Translational hematology- Edited by Seah H. Lim Article-processing charges Open access publishing is not without costs. Journal of Translational Medicine therefore levies an article-processing charge of £1370/$2145/€1745 for each article accepted for publication. If the corresponding author''s institution participates in our open access membership program, some or all of the publication cost may be covered (more details available on the membership page). We routinely waive charges for authors from low-income countries. For other countries, article-processing charge waivers or discounts are granted on a case-by-case basis to authors with insufficient funds. Authors can request a waiver or discount during the submission process. For further details, see our article-processing charge page. BioMed Central provides a free open access funding support service to help authors discover and apply for article processing charge funding. Visit our OA funding and policy support page to view our list of research funders and institutions that provide funding for APCs, and to learn more about our email support service.

中文简介: (来自Google、百度翻译)

由生物医学中心出版。ISSN: 1479 - 5876。 《转化医学杂志》是一种开放获取的期刊,主要发表从人体实验中获得的信息,从而优化基础科学和临床科学之间的交流。 该杂志涵盖了转化医学的所有领域,但也有几个专门的部分: 癌症微环境-由Davide Bedognetti编辑 心血管,代谢和脂蛋白翻译-编辑Nehal N. Mehta 细胞,组织和基因治疗-由大卫斯特龙塞克编辑 临床翻译- Lana Kandalaft编辑 组合策略-编辑保罗A.海塞托 计算模型和流行病学-编辑迈克尔利布曼和萨布丽娜莫利纳罗 疾病生物标志物-王向东编辑 病因不明的疾病-由Monica Panelli编辑 免疫生物学和免疫治疗-编辑的阿德里安机器人 免疫病毒学-由Luigi Buonaguro编辑 医学生物信息学-由Samir K. Brahmachari编辑 神经科学-路易斯F.阿尔瓜西尔编辑 营养与代谢-劳拉索尔达蒂编辑 疼痛、重症监护和麻醉- Yasin S. Al Makadma编辑 患者靶向分子治疗-由Francesco Chiappelli编辑 个性化医疗-编辑洛菲乔查内 翻译成像-编辑由Ravinder Reddy 翻译血液学-由Seah H. Lim编辑 Article-processing指控 开放存取出版并非没有成本。因此,《转化医学杂志》对每一篇被接受发表的文章收取1370英镑/ 2145美元/ 1745欧元的论文处理费。如果通讯作者所在的机构参与了我们的开放获取会员计划,部分或全部出版费用可能会被支付(更多详情请参阅会员网页)。我们通常免除低收入国家作者的费用。对于其他国家,文章处理费用的减免或折扣是在个案基础上给予资金不足的作者。作者可以在提交过程中要求弃权或折扣。详情请参阅我们的文章处理收费页面。 BioMed Central提供免费的开放获取资助支持服务,帮助作者发现和申请文章处理费用资助。访问我们的OA资助和政策支持页面,查看我们的研究资助者和为APCs提供资助的机构列表,并了解更多关于我们的电子邮件支持服务。

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