RNA Expression Profiling of Lymphoepithelioma-Like Carcinoma of the Bladder Reveals a Basal-Like Molecular Subtype.

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Abstract:

:Lymphoepithelioma-like carcinoma of the bladder (LELC-B) is a rare subtype of urothelial carcinoma consisting of undifferentiated epithelial cells within a dense inflammatory cell infiltrate. We set out to molecularly characterize LELC-B through RNA expression profiling as well as immunohistochemistry (IHC) to understand its underlying biology. Sixteen cases of LELC-B were identified at Johns Hopkins University. RNA sequencing was performed on 14 cases. IHC staining for programmed cell death ligand 1 (PD-L1) and mismatch repair proteins MutL homolog 1 (MLH1), MutS homolog 2 (MSH2), MSH6, and PMS1 homolog, mismatch repair system component 2 (PMS2) was performed. Transcriptomic profiling of LELC-B showed that they are enriched in a basal-like phenotype, with 12 of 14 LELC-B cases correlating to the basal centroid of the bladder cancer analysis of subtypes by gene expression 47 (BASE47) predictive analysis of microarrays (PAM) classifier. Gene signature analysis confirmed the lymphocyte infiltration profile consistent with the histomorphology. LELC-B lacked features to explain the robust lymphocytic infiltrate, such as loss of mismatch repair protein expression or expression of Epstein-Barr virus transcripts. Nonetheless, PD-L1 IHC was positive in 93% of LELC cases. Our study demonstrates that LELC-B tumors are enriched in a basal-like molecular subtype and share a high level of immune infiltration and PD-L1 expression, similar to basal tumors. The basal-like phenotype is consistent with the known sensitivity of LELC-B to chemotherapy and suggests that immune checkpoint therapy should be explored in this rare disease.

膀胱淋巴上皮瘤样癌的 RNA 表达谱揭示了一种基底样分子亚型。

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摘要:

: 膀胱淋巴上皮瘤样癌 (LELC-B) 是尿路上皮癌的一种罕见亚型,由密集炎性细胞浸润内的未分化上皮细胞组成。我们开始通过 RNA 表达谱以及免疫组织化学 (IHC) 对 LELC-B 进行分子表征,以了解其潜在的生物学特征。在约翰霍普金斯大学发现了 16 例 LELC-B。对 14 例进行了 RNA 测序。程序性细胞死亡配体 1 (PD-L1) 和错配修复蛋白 MutL 同源物 1 (MLH1) 、 MutS 同源物 2 (MSH2) 、 MSH6 和 PMS1 同源物的 IHC 染色, 进行了错配修复系统组件 2 (PMS2)。LELC-B 的转录组学分析显示它们富集在基底样表型中, 14 例 LELC-B 病例中有 12 例与膀胱癌基底质心相关,通过微阵列 (PAM) 分类器的基因表达 47 (BASE47) 预测分析进行亚型分析。基因特征分析证实淋巴细胞浸润谱符合组织形态学。LELC-B 缺乏解释稳健淋巴细胞浸润的特征,如错配修复蛋白表达缺失或 Epstein-Barr 病毒转录本表达。尽管如此,93% 的 LELC 病例 PD-L1 IHC 阳性。我们的研究表明,LELC-B 肿瘤富含基底样分子亚型,具有高水平的免疫浸润和 PD-L1 表达,与基底肿瘤相似。基底样表型与 LELC-B 对化疗的已知敏感性一致,并提示在这种罕见疾病中应该探索免疫检查点治疗。

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AMERICAN JOURNAL OF PATHOLOGY

研究方向:医学-病理学
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Covers current developments relating to all aspects of pathology research.

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涵盖病理学研究各方面的最新进展。

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