中华临床实验室管理电子杂志
Chinese Journal of Clinical Laboratory Management(Electronic Edition)
- 主管单位: 中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会
- 主办单位: 中华医学会
- 影响因子: 0.21
- 审稿时间: 1-3个月
- 国际刊号: 020-28078315,020-28078296
- 国内刊号: 28
- 论文标题 期刊级别 审稿状态
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建立MALDI-TOF MS鉴定的海洋致病性弧菌数据库样本前处理的适宜条件
目的 探讨建立基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)鉴定海洋致病性弧菌数据库前样本处理的适宜条件,为完善MALDI-TOF MS鉴定该菌入数据库提供参考.方法 将32株海洋致病性弧菌培养至24、48、72 h时,分别用直接转移法、扩展的直接转移法、甲酸提取法得到上机样品,然后用MALDI-TOF MS进行采图鉴定,用SPSS20.0软件进行统计学分析,对样本不同培养时间及3种处理方法的鉴定结果进行比较评价.结果 培养24 h鉴定分数平均值为2.321,属水平鉴定正确率为96.88%,种水平鉴定正确率为90.63%;培养48 h鉴定分数平均值为2.315,属水平鉴定正确率为93.75%,种水平鉴定正确率为90.63%;培养72 h鉴定分数平均值为2.316,属水平鉴定正确率为93.75%,种水平鉴定正确率为87.50%,3种不同培养时间的前处理方法鉴定至属(P=0.129)、鉴定到种(P=0.078),差异均无统计学意义.直接转移法鉴定分数平均值为1.986,属水平鉴定正确率为78.13%,种水平鉴定分数为59.38%;扩展的直接转移法鉴定分数平均值为2.135,属水平鉴定正确率为90.63%,种水平鉴定正确率为78.13%;甲酸提取法鉴定分数平均值为2.306,属水平鉴定正确率为96.88%,种水平鉴定分数为90.63%,3种不同上机前样本处理方法鉴定到属时差异有统计学意义(P=0.006);鉴定到种时差异有统计学意义(χ2=8.691,P=0.013).结论 建立MALDI-TOF MS海洋致病性弧菌数据库时,选择培养时间24 h的甲酸法提取菌体蛋白的前处理方法较适宜,可得到高质量的蛋白指纹图谱和鉴定正确率.
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两种菌体前处理方法对MALDI-TOF MS鉴定临床分离菌效果的影响
目的 评价2种不同前处理方法对基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)鉴定临床分离菌效果的影响.方法 收集临床菌株43株,划线传代后,分别使用提取法和抹板法对微生物样本进行前处理,然后用MALDI-TOF MS鉴定比较两种处理方法的准确率和蛋白指纹图谱特征.结果 以16S rRNA/ITS RNA测序结果为参考标准,待测菌株经提取法处理后,MALDI-TOF MS鉴定革兰阳性菌、革兰阴性菌和真菌的种水平准确率分别为93.8%、100.0%和30.8%,待测菌株经抹板法处理后,MALDI-TOF MS鉴定革兰阳性菌、革兰阴性菌和真菌的种水平准确率分别为75.0%、100%和7.7%.提取法处理菌株后得到的蛋白指纹图谱中特征峰更多,信噪比更高,蛋白指纹图谱重现性更好.结论 推荐采用提取法为MALDI-TOF MS鉴定的常规前处理方法,其对建立标准的微生物检测流程,提高质谱鉴定的正确率,有重要价值.
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1507例乙型病毒性肝炎患者对6种核苷类似物的耐药分析
目的 分析乙型病毒性肝炎(简称乙肝)患者应用核苷类似物抗病毒治疗出现的耐药情况.方法 对2016年1月1日至3月25日在广州金域医学检测中心检测的来自全国的1507例乙肝患者进行6种常见的核苷类似物耐药基因检测与耐药分析.结果 1507例乙肝患者中拉米夫定(lamivudine,LAM)、替比夫定(Telbivudine,LDT)和恩曲他滨(emtricitabine,FTC)耐药情况严重,耐药率均为35.24%(531/1507例),阿德福韦(adefovir,ADV)和恩替卡韦(entecavir,ETV)次之,耐药率分别为14.93%(225/150)和7.70%(116/1507).未见对替诺福韦(Tenofovir,TDF)耐药株.结论 拉米夫定、替比夫定和恩曲他滨等"低耐药屏障"药物的耐药形势严峻.核苷酸类似物耐药基因监测对有效制定用药方案、改善患者预后以及耐药形势跟踪调查,以减少或延缓耐药株产生有重要的临床指导意义.
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院内耐阿米卡星肺炎克雷伯菌氨基糖苷类耐药机制和分子流行病学研究
目的 研究临床分离的耐阿米卡星肺炎克雷伯菌亲缘关系及氨基糖苷类耐药基因的流行情况及标本分布,为临床感染控制提供依据.方法 采用WalkAway 96 PLUS全自动细菌鉴定及药敏分析仪,对2013年6月—2014年11月院内临床分离的27株耐阿米卡星肺炎克雷伯菌,进行细菌鉴定和药敏试验,采用纸片扩散法和E-test法检测部分抗菌药物的敏感性.用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测氨基糖苷类耐药基因,并对部分阳性基因进行测序.多位点序列分型法(multilocus sequence typing,MLST)鉴定菌株之间的亲缘关系.结果 27株耐阿米卡星肺炎克雷伯菌中,88.9%(24/27)16S rRNA甲基化酶基因rmtB阳性,51.9%(14/27)aac(3)-Ⅱ、40.7%(11/27)aac(6′)-I和40.7%(11/27)ant(3″)-I氨基糖苷类修饰酶基因阳性.MLST分析有9种序列类型,依次为ST37(40.7%)、ST11(40.7%)、ST1(11.1%)、ST789(11.1%)、ST15(7.4%)、ST147(7.4%)、ST76(3.7%)、ST722(3.7%)和ST290(3.7%).29.6%(8/27)的标本分布在ICU重症监护病房,18.5%(5/27)的标本分布在神经内科病房.51.9%(14/27)标本来源于痰液,37.04%(10/27)标本来源于尿液.结论 院内发生过ST11型产16S rRNA甲基化酶基因rmtB阿米卡星肺炎克雷伯菌的克隆流行株.肺炎克雷伯菌对阿米卡星耐药与携带rmtB和aac(6′)-I氨基糖苷类耐药基因关系密切.
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MALDI-TOF MS鉴定一株小菌落变异型金黄色葡萄球菌
目的 探讨运用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)技术对金黄色葡萄球菌小菌落变异型的特征性蛋白指纹图谱进行深度研究的价值.方法 分别采用传统生化鉴定、16S rRNA测序技术和MALDI-TOF MS技术对1株小菌落变异型金黄色葡萄球菌进行鉴定,通过质谱鉴定系统VITEK MS的质谱科研模式获取金黄色葡萄球菌小菌落突变株(small colony variants,SCV)的质谱图,分析代表金黄色葡萄球菌agr和sigB系统的m/z表达强度,并用SARAMIS软件构建基于质谱峰谱特征的系统发育树.结果 使用MALDI-TOF MS技术鉴定该菌株为金黄色葡萄球菌,与传统生化鉴定、16S rRNA测序技术的鉴定结果一致.其菌落形态符合典型SCV菌株的特征,预示生物膜形成的PSMα3(m/z 2634.4)、PSMα1(m/z 2286.8)和PSMα4(m/z 2198.6)的表达强度分别为100%、76.1%和32.3%,反映急性早期感染状态的agr调控系统的delta毒素强度只有10%;反映慢性、复发性感染的sigB调控系统的峰谱相对强度均<25%,该菌株和科研菌种库SCV的系统发育树近似度>70%.结论 MALDI-TOF MS技术不仅能够快速准确鉴定不典型金黄色葡萄球菌,且生成的质谱图能够初步提示菌株在宿主体内的感染状态,表明该技术具有极大的应用前景.
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质谱技术在医学检验中的应用
质谱技术是分析化学领域高复杂、高精尖的检测技术,已广泛应用于各行各业.近年来,由于质谱技术具有高灵敏度、高特异性、能够多组分同时分析等特点,非常适合于复杂生物基质中生物标志物的定量分析,因此在医学检验中的应用日益广泛.本文将结合质谱技术的特点,对其在医学检验中的发展历程及主要应用情况进行阐述,同时基于质谱仪的发展及技术应用现状,探讨其在实际应用过程中面临的问题和挑战,并展望该技术在医学检验应用中的发展趋势和方向.
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诊治感染性疾病应树立微生物思维模式:菌道之说
目前,我国规范的抗感染治疗在具体实施过程中仍然存在困难.首先,对感染性疾病诊断的准确性缺乏认识,可能导致盲目的"大包围、广覆盖"的经验性抗感染治疗.其次,对微生物感染的致病规律缺乏了解.微生物侵入人体后,致机体的病理生理变化有一定规律性,且具有特异性.这种致病性差异,在一定程度上决定了抗菌药物的疗效,因而,在"宿主-微生物-抗菌药"这个铁三角中,仅考虑"微生物-抗菌药"的双向性,即使诊断正确,采用"大包围"治疗,同样可导致抗感染失败.所以,临床医师应依据微生物生存环境和致病特性的不同,即"细菌之道",去探寻感染性疾病大可能的病原体特性以及佳的抗感染治疗策略.
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脓毒症对患者生存健康的长期影响
脓毒症始于感染,通过感染导致宿主反应失调,引起多器官功能障碍,以至威胁生命.研究发现,脓毒症患者晚期病死率明显增加;由于再次感染而再次入院的几率也增加,且感染的病原有一定的特点.另外,脓毒症长期影响还可能导致患者不同程度的认知损伤,包括抑郁和谵忘;脓毒症还是引发心血管疾病的风险因素.及时抢救脓毒症患者可减少其短期器官功能障碍,减少病死率,以及减少患者生存健康的长期影响.
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肠道微生态研究技术在代谢综合征中的应用
哺乳动物肠道内定居着数量庞大且组分复杂的微生物群,它们共同构成了肠道微生物组.近年来,人们逐渐认识到肠道微生物与一些疾病的发生和发展密切相关,如代谢性疾病、炎症性肠病、肿瘤、免疫系统以及神经系统疾病等,使得肠道微生物成为研究的热点.迅猛发展的微生物研究技术为我们提供了高效有力的技术平台,推动了对肠道微生态的系统认知,也为疾病的诊断及治疗开辟了新思路.本文旨在总结与分析目前常用微生态研究技术的新进展及其局限性,为进一步的肠道微生物组研究提供参考,并简要介绍肠道微生态与代谢综合征的相关研究成果.
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临床检验危急值的内部管理
危急值报告涉及实验室、信息科、护理部、临床医生的工作,直接关系到患者的生命安全.危急值项目的选择、报告范围和时限的确定、危急值报告制度的建立、实验室信息系统(laboratory information system,LIS)的改进和优化,是临床实验室高效准确的提供报告单,保障患者医疗质量和医疗安全的良好举措.
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基于微量元素检测分析后环节中的"工匠精神"认识和实践
作为医学实验室质量管理体系的后一个检验环节——分析后阶段,是连接实验室和客户的纽带,是至关重要的一环.在此环节实验室需要将专业的检验结果,以易读易理解的方式提供给医生和患者,将复杂的图表转化成一份检验报告单,将提示异常的箭头转换成引导健康的温馨提示,将单一的数字转化成通俗易懂的文字,既要详细客观地阐述检验结果所提示的诊疗信息又不过度表达,既要及时报告危急值又要提前准备好可能的答疑知识,这些都体现了检验工作者的敬业与仁爱之心,值得每一位检验工作者精益求精,不懈努力.
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精益管理在实验室认可中的应用
精益理念起源于日本丰田公司的管理思想,精益生产方式在工业化时代创造了一个又一个著名品牌.21 世纪初,美国将精益引入医院管理领域,并成功运用精益理念设计医疗服务流程,降低医疗成本,"精益医疗"成为快速提高医生工作效率、改善服务品质、提升医院效益的新管理体系.
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不忘初心共建临床实验室管理学术交流平台
时光如注,日月如梭.转瞬之间,中华临床实验室管理电子杂志创刊至今已迈入第6年的历程.俱往矣,中华临床实验室管理电子杂志在全体编委和广大检验界同仁的鼎力支持和关心下,始终坚持报道临床实验室管理的概念、理论和技术方法等,为临床检验及相关医疗工作者提供学术信息和研究成果交流平台,促进临床检验服务质量和效率的提高的办刊宗旨,不断摸索探讨,迎战困难与挑战,沿着创刊之初办刊的目标坚定前行.
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微生物感染实验室与临床沟通案例解析
检验医学是当今医学领域发展快的学科之一,技术的进步使医学实验室的简单手工操作被自动化、系统化及规模化取代.随着医疗质量的全面提高,临床对于检验服务质量要求成为超越单纯临床标本检验的更重要工作.这就凸显了精通检验技术、熟悉诊疗过程、善于沟通交流以及具备指导医疗行为能力的检验医师工作的重要意义,他们可以搭建检验与临床专业信息交流的平台[1,2],因此建立以检验医师为核心的临床沟通制度至关重要.
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临床实验室生物安全的66个相关文件解读
目前,已制定临床实验室生物安全相关文件66个,内涵丰富,涉及面广,是做好实验室生物安全管理的基础本要求.要做好实验室生物安全工作,首先要理解生物安全相关文件分类,分清文件层次及学科类别,从抓重点的、结合实际和务求实用的、分类解读和有据可依的、与时俱进的原则,以遵从基本和全面解读,理解临床实验室生物安全文件.