分子诊断与治疗杂志
Journal of Molecular Diagnosis and Therapy 분자진단여치료잡지
- 主管单位： 中山大学
- 主办单位： 中山大学
- 影响因子： 0.65
- 审稿时间： 1个月内
- 国际刊号： 1674-6929
- 国内刊号： 44-1656/R
- 论文标题 期刊级别 审稿状态
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广西玉林特殊教育学校耳聋相关基因突变分析
目的 分析广西玉林地区耳聋患者相关致病基因突变,初步了解玉林地区耳聋患者发病的分子机制.方法 对玉林地区2个特殊教育学校191例耳聋患者进行分子病因信息采集,对6岁以上患者行纯音测听和声导抗进行听力评估;小于6岁的患儿行40Hz相关电位、畸变产物耳声发射(distortion product otoacoustic emission,DPOAE)和听性脑干反应(auditory brainstem response,ABR)进行听力评估.采集外周血4mL并提取基因组DNA,用耳聋基因微阵列芯片技术对4个致聋基因的9个突变位点(GJB2基因:c.35delG、c.235delC、c.176de116、c.299delAT;GJB3基因:c.538C＞T;SLC26A4基因:c.919-2A＞G、c.2168A＞G;线粒体DNA 12SrRNA基因:m.1494C＞T、m.1555A＞G)进行基因突变分析.结果 在28例耳聋患者中检出GJB2、SLC26A4和线粒体DNA 12SrRNA基因突变,总检出率为14.66％(28/191),其中GJB2基因c.235delC纯合突变3例,c.176_191de116和c.235delC复合杂合突变1例,c.235delC杂合突变2例,c.299_300delAT杂合突变合并SLC26A4基因c.919-2A＞G杂合突变1例;SLC26A4基因c.919-2A＞G纯合突变4例,c.919-2A＞G杂合突变13例,c.919-2A＞G和c.2168A＞G复合杂合突变2例;线粒体DNA 12SrRNA基因m.1555A＞G均质突变2例. 结论 广西玉林地区耳聋患者热点突变基因以SLC26A4基因为常见.玉林地区耳聋患者的相关基因检出阳性率、GJB2基因、SLC26A4基因及线粒体DNA 12SrRNA基因的携带率均低于全国平均水平.
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玉林437例高危型人乳头瘤病毒感染与宫颈上皮内瘤变的分析
目的 调查玉林地区妇女生殖道高危型人乳头瘤病毒(human papilloma virus,HPV)感染与宫颈上皮内瘤病变(cervical intraepithelial neoplasia,CIN)的关系. 方法 应用导流杂交基因芯片技术(HybriMax),对妇科门诊就诊的3 317例有性生活史的妇女,采集宫颈脱落细胞进行HPV分型检测,对检查HPV高危型别阳性者进行宫颈活组织检查. 结果 自2014年7月至2015年6月期间,共检测我院就诊病例3 317例,检出高危型HPV感染者694例,阳性率为20.92％.对437例进行宫颈活组织检查,CIN 26例,占5.95％ (26/437),其中CINⅡ～Ⅲ12例,占2.74％ (12/437). 结论 玉林地区妇女高危型HPV感染率及高危型HPV感染者宫颈病变检出率均较高,本地区妇女宫颈上皮内瘤病变常见的高危型HPV类型为HPV16、52、58、18、33.
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11 530例佛山市妊娠晚期妇女B族链球菌感染情况的回顾性分析
目的 回顾性分析佛山市妊娠晚期妇女感染B族链球菌(group B streptococcus,GBS)的相关因素,为孕妇人群做好GBS早期干预治疗提供依据. 方法 选取2015年我院11 530名进行常规产检的妊娠晚期妇女,采集阴道分泌物标本11 530份,直肠分泌物标本11 427份,采用聚合酶链反应方法测定阴道和直肠分泌物标本中GBS特定基因(CAMP)以此作为判定GBS阳性的标准,并对检品的来源、检体年龄、检品收集时间等进行回顾性分析,以评价妊娠晚期GBS感染情况.结果 不同标本阳性检出率结果显示,11 530份阴道分泌物标本中,GBS阳性的有818例,阳性率为7.09％,11427份直肠分泌物标本中,GBS阳性的有832份,阳性率为7.28％,两者阳性检出率无显著性差异(P＞0.05);阴道和直肠分泌物联合检查与单独检查阳性率结果显示,联合检查的11 427份标本中,GBS阳性标本1 160份(直肠与阴道分泌物同时阳性482份,直肠或阴道分泌物单独阳性678份),阳性率为10.15％,与阴道或直肠分泌物单独检查比较有统计学差异(P＜0.01).不同年龄的标本阳性率结果显示,35～39岁年龄组的标本阳性率高,与其他比较,差异无显著性(P＞0.05).不同季节检查的样本阳性率结果显示,夏季收集的样本阳性检出率略高于其他季节,但各季节间比较无显著差异(P＞0.05). 结论 孕妇年龄、标本采集季节因素对妊娠晚期孕妇GBS阳性率影响不大,阴道分泌物和直肠分泌物联合检查更有利于临床及时的诊治.
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运用全外显子组测序技术诊断非综合征性耳聋基因变异
目的 评价全外显子组测序(whole-exome sequencing,WES)技术在非综合征性耳聋患者基因变异诊断临床应用的可行性. 方法 利用Illumina Hiseq2000平台对15例耳聋患者标本进行全外显子捕获测序,重点关注80个耳聋相关基因的序列捕获效率及变异检测情况并运用常规测序验证. 结果 目标区域(region of interested,ROI)20X以上平均覆盖度为98％;在15份耳聋患者标本中均发现致病性变异,涉及GJB2、SLC26A4、DSPP、TECTA和CHD7基因,其中,无义突变2个,移码突变4个,剪切位点变异1个,其余为错义突变.经常规Sanger测序验证,结果一致. 结论 全外显子组测序技术可快速可靠诊断非综合征性耳聋患者基因变异.
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地中海贫血产前遗传筛查流程简化的风险评估
目的 评估全血细胞分析(full blood count,FBC)结合常见地中海贫血(简称地贫)基因检测(简称两步法)取代传统的FBC结合血红蛋白(hemoglobin,Hb)分析和地贫基因检测(简称三步法)用于地贫产前遗传筛查的可行性. 方法 采用回顾性分析的方法,对近2年(2014年1月1日至2015年12月31日)珠海市产前门诊6291名孕妇及其配偶FBC、Hb分析和地贫基因检测的结果采用x2检验进行统计学分析,比较两步法和三步法在产前地贫遗传筛查中的可靠性及经济性. 结果 以经典的三步法作为标准,两步法对孕妇及其配偶地贫检测的灵敏度、特异性、阴性预测值和阳性预测值以及总的诊断效率分别为98.25％、99.52％、85.98％、88.12％、91.23％,两步法对血红蛋白H(hemoglobin H,HbH)病、轻型β-地贫、异常Hb和δβ-地贫/遗传性持续性胎儿血红蛋白综合征(hereditary persistence of fetal hemoglobin,HPFH)的漏检率分别为2.59％ (2/77)、0.01％ (2/1 695)、8.78％ (13/148)和48.30％ (43/89).结论 产前地贫遗传筛查流程中采用三步法有其科学性,既可避免HbH、异常Hb以及δβ-地贫/HPFH等个体的漏检,还可为地贫DNA诊断指明方向.在未建立覆盖中国人异常Hb病基因谱的分子筛查技术之前,两步法暂不能取而代之.
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非特殊型浸润性乳腺癌HER-2检测方法的对比研究
目的 应用实时定量PCR技术(quantitive real-time PCR,qPCR)检测石蜡包埋非特殊型浸润性乳腺癌标本的HER-2表达状况,与免疫组织化学技术(immunohistochemistry,IHC)和荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH)相应检测结果进行比较,以验证qPCR技术检测HER-2方法的可靠性和实用性. 方法 采用FISH和qPCR技术对IHC检测结果分别为HER-2(0、1+、2+、3+)的乳腺癌标本各100例进行检测,用kappa检验分析三者的一致性. 结果 100例HER-2 (0)和HER-2(1+)的标本HSH和qPCR的检测结果均无扩增,符合率100％;IHC检测HER-2(2+)的标本,FISH和qPCR检测结果之间k=0.731 (P＜0.001),二者一致性强;IHC检测HER-2(3+)的标本,HSH与qPCR检测结果k=0.634 (P＜0.001),二者具有较好的一致性,与IHC检测结果也具有较强的一致性.三者对乳腺癌患者的临床病理指标反应具有较好的一致性. 结论 qPCR方法简便、实用、有效,检测乳腺癌HER-2基因状况可与HSH法互为补充.
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沉默Kin17表达抑制乳腺癌细胞MDA-MB-231的增殖
目的 探讨沉默Kin17表达对乳腺癌细胞生长增殖的影响,为评估该分子作为未来药物靶点的潜能提供依据. 方法 分别用携带Kin17基因特异性siRNA与正常对照siRNA的慢病毒重组载体感染MDA-MB-231细胞,再用嘌呤霉素进行抗性筛选,然后在荧光显微镜下观察阳性细胞的比例;用Real-time PCR与Western blot方法检测稳定转染了慢病毒重组载体的MDA-MB-231细胞中的Kin17mRNA与蛋白表达水平;CCK-8实验检测细胞生长增殖状况. 结果 通过感染携带Kin17特异性siRNA的病毒重组载体,稳定、明显敲减了MDA-MB-231细胞中的Kin17 mRNA与蛋白表达水平,而且显著减缓了该乳腺癌细胞的生长增殖速度. 结论 沉默Kin17表达能抑制三阴表型乳腺癌细胞的增殖,并有可能成为一种潜在的乳腺癌治疗新策略.
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维生素D缺乏影响受孕及胚胎发育的小鼠动物模型研究
目的 通过建立小鼠模型考察维生素D缺乏对受孕力水平及胚胎发育的影响. 方法 采用数字随机法则将雌鼠分为维生素D缺乏组(vitamin D deficiency,VDD组)与对照组(Control组),VDD组采用维生素D低含量饲料喂养,Control组采用标准饲料喂养,喂养2周后合笼.结果 GD13时,VDD组孕鼠的胚胎着床数(9.52±1.75)显著低于Control组的(13.34±2.16) (P＜0.01);VDD组孕鼠的胎儿流产率明显上升;VDD组孕鼠的胎盘重量为(0.058 7±0.017 6)g,显著低于Control组的(0.078 6±0.014 3)g(P＜0.01);VDD组孕鼠的胎盘海绵体滋养层细胞面积为(86.20±6.06)％,显著小于Control组的(100.00±4.51)％(P＜0.01);GD21时,VDD组孕鼠的血清25(OH)D浓度为(6.32±0.51) nmol/mL,Control组孕鼠的血清25(OH)D浓度为(13.46±0.62) nmol/mL,组间比较Control组显著更高(P＜0.01),与Control组比较,VDD组的活胎数、孕鼠孕期增重、胎鼠体重、胎盘重量及胎鼠身长显著降低(P＜0.01),吸收胎数与死胎数显著增加(P＜0.05或P＜0.01). 结论 母体维生素D缺乏是导致小鼠受孕力水平降低及妊娠后胚胎发育迟缓的重要影响因素之一,在孕前及孕期科学补充维生素D对提高育龄期小鼠受孕力水平及保障妊娠后胚胎良性发育具有重要意义.
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河池地区乙型肝炎病毒基因型分布的相关性研究
目的 分析河池地区乙型肝炎病毒基因分型分布情况及与乙型肝炎病毒DNA定量、乙型肝炎E抗原定量检测的各项指标间的相关性. 方法 对临床154例乙型肝炎病毒DNA阳性患者,采用PCR-反向点杂交法检测乙型肝炎病毒基因分型;采用实时荧光定量PCR法定量检测乙型肝炎病毒DNA载量;采用时间分辨法进行乙型肝炎E抗原定量检测;分析彼此间的相关性. 结果 经统计,B型83例,占53.9％;C型68例,占44.16％;非B非C型共3例,占6.2％;男女性患者基因分型的构成比差异无统计学意义.C型乙型肝炎病毒DNA水平、C型乙型肝炎肝炎E抗原定量测定阳性均高于B型. 结论 河池地区乙型肝炎病毒基因型以B型为主,C型次之;C型乙型肝炎病毒DNA含量、乙型肝炎E抗原定量测定阳性均高于B型.
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云南昆明地区非小细胞肺癌EGFR突变情况研究
目的 研究昆明地区非小细胞肺癌(non-small cell lung canncers,NSCLCs)表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因突变特点及与临床特征(性别、年龄、吸烟、组织学分型)的相关性. 方法 采用突变扩增阻滞系统(amplification refractory mutation system,ARMS)检测昆明地区173例非小细胞肺癌EGFR基因第18～21号外显子基因突变情况,并分析其突变与临床特征的关系. 结果 173例NSCLCs共检测EGFR突变38.7％(67/173),其中外显子19和21突变分别占突变总数的58.2％ (39/67)和25.4％ (17/67);腺癌和腺鳞癌基因突变率分别为44.1％ (64/145)和60％(3/5);无吸烟史EGFR突变率51.1％(48/94)显著高于有吸烟史患者24.1％(19/79),P＜0.05;女性EGFR突变率分别为49.4％ (44/89)显著高于男性27.4％ (23/84),P＜0.05. 结论 云南昆明地区NSCLCs患者EGFR基因突变主要以19号外显子缺失突变和21号外显子点突变为主,多见于女性、无吸烟史、腺癌和腺鳞癌患者.
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新型肿瘤标志物人附睾蛋白4的临床应用
人附睾蛋白4(human epididymis 4,HE4)是近年来新发现的肿瘤标志物.卵巢癌风险评估(risk of ovarian malignancy algorithm,ROMA)模型通过计算HE4和CA125的联合指数,对于卵巢癌的诊断有较高参考价值.目前血清HE4水平作为卵巢癌诊断、疗效评估及预后判断的新指标已经逐渐应用于临床.亦有研究显示HE4在肺癌患者血清和恶性胸腔积液患者胸水中呈现较高水平表达,提示其在肺癌诊断、预后评估方面的良好作用.本文就HE4在卵巢癌及肺癌的研究现状作一综述,以系统展示HE4的生物学诊断价值.
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克雅病的分子诊断
克雅病(creutzfeldt-jakob disease,CJD)是一种神经系统退行性疾病,临床少见,其早期诊断较困难.目前诊断CJD的分子手段有3种:免疫组织化学、基因检测及脑蛋白标志物.免疫组织化学法发现异常朊蛋白是确诊的金标准,但是很大部分患者生前无法接受脑组织的免疫组织化学检查;基因检测可对CJD的分型及家族性CJD的诊断提供依据,但不是所有朊蛋白基因突变均会导致CJD;脑蛋白标志物的检测在临床上较实用,但所有脑蛋白标志物均有特异性的缺陷.本文旨在总结CJD在分子水平上的研究结果及进展.
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HBV核苷(酸)类似物耐药突变及其检测技术的临床应用
目前,可供临床应用的抗慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)的核苷(酸)类似物[nucleos(t)ide analogs,NAs]包括拉米夫定(lamivudine,LAM)、替比夫定(telbivudine,LdT)、阿德福韦酯(adefovir,ADV)、恩替卡韦(entecavir,ETV)及替诺福韦酯(tenofovir,TDF),NAs作为病毒逆转录酶抑制剂,可抑制HBV DNA复制扩增.由于HBV属于高基因变异率病毒,NAs长期治疗后,选择压力下使耐药病毒株成为优势株,影响治疗效果.因此,为防治CHB抗病毒治疗中耐药的发生,弄清楚其耐药机制及变异的监测及诊断十分必要.本文总结了近年来发现的常见突变位点,并比较了几种临床应用的突变监控及检测技术,对耐药突变进行早期、快速检测具有重要临床意义,使慢性HBV感染的监测达到优化.
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下一代测序(NGS)技术的发展及在肿瘤研究的应用
下一代测序(next-generation sequencing,NGS)由于高灵敏度、高通量、高度自动化等特性,近年来在疾病的研究和诊断治疗中越来越多地被应用.下一代测序技术的发展为肿瘤分子生物学的研究提供了新的手段.本文就下一代测序技术的种类、特点、发展趋势及其在肿瘤研究中的应用作简要的综述.
